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該館所藏古籍主要來自澳門藏書家姚鈞石（蒲坂書樓），小部分來自山東藏書家龐鏡塘（贏縮研齋），其中包含少量楊氏海源閣舊藏
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法国国家图书馆向中国国家图书馆赠送的馆藏全部敦煌遗书高清数字资源
敦煌写经资料库，目前只有敦煌法藏
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